Brundibar es la historia de Pepíchek y Aninka, dos niños que tienen que comprar leche para su madre enferma, pero están tristes porque no tienen dinero. Un perro, un gato y un gorrión se ofrecen a ayudarlos, convenciendo a los niños del pueblo de cantar con ellos. Pero cerca de ellos estará siempre Brundibar, un músico que no tiene demasiadas buenas intenciones.